Markko Märtin (d. 10 Kasım 1975, Tartu) Estonyalı ralli sürücüsü.

1997 senesinde Toyota takımında kariyerine başladı. Co-pilotu ise Michael Park'tı. Ancak 2000 senesinde Subaru takımına geçti. 2003'te Ford takımı Colin McRae'den boşalan koltuğu bu pilotla doldurdu. 2005te Peugeot takımına geçti. Ancak co-pilotunun ölümü ile kariyerini braktı. Dünya Ralli Şampiyonası'nda 5 yarış kazandı.