Fosfodiester bağı nasıl bulunur?

Fosfodiester bağı nasıl bulunur?

Fosfodiester bağı, DNA ve RNA'daki fosfatların, şekerlerle yaptığı bağa verilen addır. Bu bağ, doğadaki en güçlü kovalent bağlardan biridir. Fosfodiester bağı, ardışık nükleotit şekerlerinden birisinin 5'-hidroksil grubunun, diğerinin 3'-hidroksil grubuna fosfat köprüsü aracılığı ile bağlanmasıyla oluşur.
Sonuç olarak uzun ve düz bir zincir yapısı belirir. DNA'nın ana iskeletini de bu deoksiriboz-fosfat bağı zinciri oluşturur. Bu iskelet boyunca var olan baz dizileri genelde zincirin 5' ucundan 3' ucuna doğru azalır. DNA ve RNA'da yer alan nükleotitlerdeki fosfolipit bağları hidroliz veya enzimler aracılığıyla parçalanabilir. Bu enzimlere nükleaz adı verilir. Aynı şekilde, DNA'daki bağları parçalayan enzime deoksiribonükleaz, RNA'daki bağları parçalayan fosfodiester bağına ribonükleaz adı verilmektedir.

SORU Toplam nükleotid sayısı 5600 olan bir DNA molekülünde 1000 tane timin vardır. Bu DNA'da toplam kaç tane
hidrojen bağı bulunur?

ÇÖZÜM
Önce tüm nükleotid sayısını hesaplayalım
A=T - T=1000---> A=1000
DNA = A+T+G+C
5600 = 1000+1000+G+C
G+C = 3600 --> G = C
G = C 3600/2 = 1800
A ile T arasında 2’li zayıf hidrojen bağı (A=T), G ile C arasında ise 3’lü zayıf hidrojen bağı (G≡C) vardır.
A=T 1000x2=2000 ( A ile T arasındaki Hidrojen bağı)
G=C 1800x3=5400 (G ile C arasındaki Hidrojen bağı)
2000+5400=7400 tane zayıf hidrojen bağı vardır.
CEVABI 7400 tane zayıf hidrojen bağı.

DNA Hesaplaması örnekleri DNA (Deoksiribo Nükleik Asit)