Tohumun Çimlenmesi
Tohumdaki embriyonun uygun şartlar bulunca gelişerek ana bitkiye benzer bitki vermek üzere tohumdan çıkıp serbest hale geçmesine çimlenmedenir. Çimlenme esnasında önce tohumda bir şişme meydana gelir. Embriyo hücrelerinin arka arkaya bölünmesi ile testaçatlatılır ve bu çatlayan kısımdan önce radikula, sonra embriyonun diğer kısımları dışarı çıkar. Önceleri tohumdaki besin maddeleri ile beslenen embriyo ışığa çıkınca kendi yeşil yaprakları ile kendi besin maddesini yapar. Böylece genç bitki meydana gelmiş olur.
Tohumdaki kotiledonların çimlenmedeki durumlarına göre çimlenme 2 tiptir:
1-Epigeik çimlenme
2- Hipogeik çimlenme

1-Epigeik çimlenme
Kotiledonlar, hipokotilin uzaması ile toprak yüzeyine çıkarak kısa bir süre yaprak gibi fotosentez yaparlar. Hipokotil uzamış, epikotil kısalmıştır.
Ör: Phaseolus (Fasulye), Ricinus (Hint yağı), Pinus (Çam).

2- Hipogeik çimlenme
Kotiledonlar toprak altında testa içerisinde kalarak, plumula gelişip yapraklı gövdeyi verirken çürürler. Böyle tohumlarda hipokotil hiç uzamaz veya bulunmaz, epikotil ise uzamıştır.
Ör: Pisumsp. (Bezelye), Triticumsp. (Buğday).

Tohumda uyku hali
1-Tohumda metabolizma yavaş fakat devam etmektedir
2-Süre tohum kabuğuna ve besin miktarına bağlıdır
3-Kuru ve soğuk koşullarda uyku halinde kalarak canlılığı korumakta ve neslin devamını garanti altına almaktadır
4-Tohumlarda uyku halinin devamı sağlayan hormon absisik asittir
5-Tohumlarda canlı ve çimlenme yetenekli kalma süresi türe göre değişir

Çimlenme gücü
a-Tohum kabuğu kalınlığına
b-Tohumdaki su miktarının azlığına
c-Depo besinlerden yağ yerine nişastanın varlığına bağlı olarak artar.

Tohumda çimlenme
Gerekli şartlar
1-Su: Kabuğun çatlaması,embriyonun serbest kalması ve enzimatik reaksiyonlar için gereklidir
2-Oksijen: Artan metabolizma için gerekli enerji oksijenli solunumla karşılanır
3-Sıcaklık: Artan enzim etkinliği uygun sıcaklıklarda gerçekleşir
4-Işık: Bazı türlerde (Tütün) çimlenmede ışığa ihtiyaç duyulur.

Bitki gelişmesinde rol alan faktörler
Su

• Turgor oluşumu
• Madde taşınım
• Fotosentezde organik madde sentezi
• Terleme ile ısı düzenlenmesi
• Stomaların çalışması
• Enzimatik reaksiyonlar için ortam
• Hidroliz reaksiyonlarının gerçekleşmesi

Sıcaklık

• Enzim etkinliği ve metabolizmada etkendir
• Terleme üzerine etkendir
• Topraktan su alınımı da etkendir

Işık

• Klorofil sentezinde gereklidir
• Fotosentezde gereklidir
• Bazı türlerde çimlenmede gereklidir

pH, Tuz ve Mineral

• Enzim etkinliği için gereklidir
• Bazı moleküllerin (Enzim, hormon, pigment vb.) yapısına katılır

Hormonlar

• Bitkisel hormonlar bitkinin büyümesi, yaprak-çiçek açması, yönelim, meyve oluşumu, Tohumda uyku ve çimlenme vb. yaşamsal olayların gerçekleşmesinde rol alırlar