Amino Asitler
Amino asitlerde ortak özelliklerin ve yapıların gösterimi; yan zincirler, iyonik formlar, stereo-izomerler;
Proteinlerde ortak 20 amino asidin herbirinin yapısı, üç harfli ve tek harfli kısaltmaları;
Boyut, yük, zayıf asit davranışı, kimyasal reaktivitesi, hidrojen bağı oluşturma kapasitesi ve hidrofilik ve hidrofobik tabiatı açılarından 20 amino asidin tanınması;
Amino Asitler
Amino asitler, yapılarında hem amino grubu (NH2) hem de karboksil grubu (nCOOH) içeren bileşiklerdir.
Fizyolojik pH’da, amino asitlerin amino grubu proton taşır ve pozitif yüklüdür; karboksil grubundan ise proton ayrılmıştır ve negatif yüklüdür.
- Amino asitlerin yapısında bir karbon atomunun dört valansına dört farklı grup bağlanmıştır. Bu gruplardan üçü (-COOH, -NH2 ve -H) değişmez.
- Karbon atomunun 4. valansına bağlanan R grubu ise değişerek çeşitli amino asitlerin türemesini sağlar.
- R grubuna amino asidin yan zinciri denir. Amino asitler, amino grubunun karboksil grubuna göre bulunduğu pozisyona bağlı olarak (- alfa- ve betta- amino asit şeklinde adlandırılırlar.
D- ve L- Amino asitler
- D- ve L- simgeleri amino asitlerin polarize ışığı sağa yada sola çevirdikleri anlamına gelmez, sadece D- ve L-gliseraldehide benzerliklerine göre amino asitlerin D ve L serisine dahil olduklarına işaret eder.
- Doğal olanları L-serilerdir ve canlı organizmalar daima L-amino asitleri kullanırlar.
- Bitkisel ve hayvansal proteinlerin kuruluşuna sadece L-amino asitler katılırlar.
- D-amino asitleri ise genellikle bakterilerin hücre duvarlarında bulunurlar (D-glutamik asit vb).
- Bazı insekt larvalarından yada krizalitlerinden elde edilen D-alanin ve yer solucanından elde edilen D-serin diğer örnekleri oluştururlar
Protein yapısında yer alan 20 amino asit doğada yaygın olarak bulunur.
Amino asitlerin sınıflandırılması